این روش از انواع روش های کروماتوگرافی مایع است، بنابراین از نظر دستگاهوری و اجزاء و وظایف هرکدام مشابه روش کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا است. فاز ساکن و متحرک هر دو قطبی هستند. در این روش بین فاز متحرک که معمولا به صورت محلول است و حاوی نمونه ای است که دارای اجزاء قابل یونیزه می باشد، و فاز ساکن که باردار است، به صورت تعادلی و برگشت پذیر تبادل یون انجام می شود. فاز ساکن از پلیمر های سنتزی شامل گروه های باردار تشکیل شده است که این گروه های باردار می توانند گروه های آنیونی یا کاتیونی باشند.